Статья: Разработка иммуногенетической модели риска развития туберкулеза легких методом логистической регрессии

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

Данные результаты свидетельствуют о том, что прогностическим потенциалом для ранней диагностики развития определенной формы туберкулеза обладают только гены системы HLA. Это комплекс генов, расположенных на коротком плече 6-й хромосомы и обеспечивающих регуляцию иммунного ответа [9]. Для очаговой и фиброзно-кавернозной форм были обнаружены значимые предикторы, что дает нам возможность выявить минимальное количество потенциальных биомаркеров, которые можно использовать в качестве кандидатных полиморфизмов для данных фенотипов туберкулеза. Генетические характеристики пациента (гены системы HLA) позволяют определять вероятность развития тяжелой (фиброзно-кавернозной) или легкой (очаговой) формы туберкулеза легких. Пример расчета вероятности развития определенной формы туберкулеза (фиброзно-кавернозной) рассмотрен ниже (табл. 3).

Таблица 3

Пример вычисления логита у пациента с туберкулезом, в генотипе которого есть аллели генов HLA B*08 и DRB 1*03

Показатель

Вариант

ответа

Код

Коэффициент регрессии at

Произведение

(Код х ai)

Результат

HLAB*08

имеется

1

1,81

1,81x1

1,81

HLADRB1*03

имеется

1

1,57

1,57x1

1,57

Константа

-2,4849

Логит (Р)

Сумма

0,8951

Поскольку P больше 0,5, у данного пациента есть высокий риск развития фибрознокавернозной формы туберкулеза.

Заключение

Несмотря на многочисленные исследования, в настоящее время нет маркеров, которые однозначно могли бы помочь в диагностике туберкулеза. Прогнозирование развития различных форм заболевания с помощью метода множественной логистической регрессии позволяет провести предиктовую диагностику до формирования клинических признаков, что важно для повышения эффективности лечения. Использование генетических маркеров и математических методов исследования развития тяжелой или легкой формы заболевания даст возможность выделить среди больных группы высокого риска. Это необходимо для трансформации иммуновоспалительного ответа с гиперпродуктивного на толерантный для снижения деструкции пораженного органа. В настоящее время данный подход является оптимальным, поскольку применение комплекса диагностических мероприятий способствует выбору правильной тактики лечения, а также снижает риск прогрессирования инфекции и развития тяжелых форм туберкулеза.

Список литературы

Aravindan P.P. Host genetics and tuberculosis: Theory of genetic polymorphism and tuberculosis. Lung India. 2019. Vol. 36. no.3. P.244-252. DOI:

10.4103/lungindia.lungindia_146_15.

Никулина С.Ю., Чернова А.А., Шульман В.А., Верещагина Т.Д., Чернов В.Н. Модель логистической регрессии как дополнительный математический метод прогнозирования нарушений сердечной проводимости в семьях г. Красноярска // Российский кардиологический журнал. 2014. №10 (114). С. 46-52. DOI: 10.15829/1560-4071-2014-10-4652.

Gideon H.P., Flynn J.L. Latent tuberculosis: what the host “sees”? Immunological Reviews. 2011. Vol. 50. Is. 2-3. P. 202-12. DOI: 10.1007/s12026-011-8229-7.

Cai L., Li Z., Guan X., Cai K., Wang L., Liu J., Tong Y. The Research Progress of Host Genes and Tuberculosis Susceptibility. Oxidative Medicine and Cellular Longevity. 2019. Vol. 2019. id 9273056. DOI:10.1155/2019/9273056.

Hammer О., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontologia Electronica. 2001. Vol. 4. is. 1. art. 4. P. 9 https://palaeo-electronica.org/2001_1/past/issue1_01.htm (дата обращения 20.08.2020).

Григорьев С.Г., Лобзин Ю.В., Скрипченко Н.В. Роль и место логистической регрессии и ROC-анализа в решении медицинских диагностических задач // Журнал инфектологии. 2016. 8(4). С.36-45. DOI: 10.22625/2072-6732-2016-8-4-36-45.

Беляева С.В. Гены иммунного ответа и их комбинации в качестве предиктовых маркеров потенциального риска развития активного туберкулеза легких и его клинических фенотипов у представителей русской популяции Челябинской области: автореф. дис. ... канд. биол. наук. Челябинск, 2014. 23 с.

Бурмистрова А.Л., Беляева С.В. Визуализация генетических комбинаций, участвующих в формировании воспалительного ответа при туберкулезе легких, методом канонического анализа соответствий // Вестник Челябинского государственного университета. 2015. № 21 (376). Биология. Вып. 3. С. 12-16.

Candore G, Lio D., Colonna Romano G., Caruso C. Pathogenesis of autoimmune diseases associated with 8.1 ancestral haplotype: effect of multiple gene interactions. Autoimmunity Reviews. 2002. Vol. 1. Is. 1-2. P. 29-35. DOI: 10.1016/S1568-9972(01)00004-0.

Источник: https://otherreferats.allbest.ru/download/1291114/