Механизм действия антибиотиков различный. Под влиянием пенициллина происходит нарушение процессов метаболизма в микробной клетке, связанные с образованием клеточной стенки, что ведет к появлению особей, не способных к размножению.
Антибактериальное действие стрептомицина, тетрациклина, левомицетина проявляется подавлением синтеза белков.
В настоящее время выпускается много различных антибиотиков, которые с успехом используются в клинике инфекционных болезней, хирургической, кожных и венерических, внутренних болезней и др. Вместе с тем следует отметить, что иногда применение антибиотиков вызывает у больных побочные явления: появление крапивницы, токсикодермия нарушение функции кроветворной, нервной систем и органов. Введение в организм больших доз антибиотиков может нарушить жизнедеятельность нормальной микрофлоры дыхательных путей, кишечника и мочеполовых органов. Это приводит к изменению обычных антагонистических отношений между микробами в естественных условиях. В результате этого условно патогенные бактерии и грибы из рода Candida могут активизироваться и вызвать вторичные инфекционные процессы. Примером могут служить кандидозы кожи и слизистых оболочек, кандидозный сепсис, пневмонии, пиелоциститы, колиты и другие заболевания. Наблюдаются случаи рецидивов брюшного тифа и скарлатины после применения антибиотиков.
При неправильном лечении антибиотиками возникают устойчивые к этим препаратам штаммы патогенных микроорганизмов. Появление таких возбудителей инфекционных заболеваний значительно снижает терапевтический эффект от применения определенных антибиотиков. Вот почему в настоящее время необходимо определять чувствительность микробов, выделенных из организма больных людей к различным антибиотикам. Такое определение имеет большое значение для медицинской практики, так как позволяет врачу применить для лечения больного наиболее эффективный антибиотик (см. стр. 121).
Антибиотики, получаемые из микроорганизмов. Пенициллин. В период второй мировой войны было получено антибактериальное вещество, накапливающееся в культурах зеленого кистевика, названное пенициллином.
Пенициллин действует бактериостатически и бактерицидно на грамположительные кокки — стафилококки, стрептококки, пневмококки, палочку сибирской язвы, палочку дифтерии, анаэробных спороносных палочек, а также на гонококки, менингококки, спирохеты сифилиса, возвратного тифа, лептоспиры, лучистые грибы и другие патогенные микроорганизмы. Он неактивен по отношению к грамотрицательным бактериям кишечно-тифозной группы, туберкулезным микобактериям и ряду других микроорганизмов.
Пенициллин легко разрушается под действием спирта, кислот, щелочей, металлов, а также под влиянием фермента пенциллиназы, выделяемого многими бактериями, включая Е. coli. Так как пенициллин малотоксичен, то его вводят преимущественно парентерально, чаще всего внутримышечно. Пенициллин применяют в жидких и твердых мазях, в виде порошка на очаги поражения. В настоящее время пенициллин выпускается в различных лекарственных формах: феноксиметилпенициллин (для пероралыюго применения), экмоновоциллин (препарат, обеспечивающий длительное действие), бициллин-1, бициллии-2 и др. В настоящее время разработаны методы получения полусинтетических пенициллинов (метициллин, оксациллин, ампициллин и др.), действующих на устойчивые к пенициллину стафилококки.
Гр амицидин. Получен из культуры Bact. brevis. Он обладает выраженными антибактериальными свойствами в отношении грамположительных микробов, отчего и получил свое название.
Аналогичный антибиотик был получен в 1942 г. советскими учеными Г. Ф. Гаузе и М. Г. Бражниковой, которые назвали его грамицидином С. Наиболее чувствительны к этому препарату стафилококки, стрептококки, пневмококки и анаэробные бациллы. Он проявляет антагонистическое действие и в отношении некоторых грамотрицательных бактерий.
При местном применении препарат нетоксичен для животных тканей. Внутривенно грамицидин не применяется ввиду его гемолитических свойств.
Стрептомицин. Н. А. Красильников и А. И. Кореняко впервые установили антагонистическое действие лучистых грибов. В 1944 г. С. Я. Ваксман получил антибиотик — стрептомицин из лучистого гриба, выделенного из почвы. Это антибиотическое вещество действует на грамположительные и грамотрицательные палочки (брюшного тифа, коклюша и др.). Стрептомицин широко применяется при лечении туберкулеза, туберкулезного менингита, туляремии, дизентерии и др. Стрептомицин вводят внутривенно, внутримышечно, в спинномозговой канал, под кожу и местно на очаги поражения.
Ауреомицин (биомицин). Получен из культуры Actinomycesaureofaciens. Этот антибиотик представляет собой органическое соединение слабощелочной реакции. Получен в виде порошка, растворимого в воде и физиологическом растворе. Оказывает антибактериальное действие на грамположительные и грамотрицательные бактерии, активен в отношении риккетсий и дизентерийных амеб.
Хлоромицетин. Получен из гриба Actinomycesvenezuella. Подавляет рост грамположительпых и грамотрицательных бактерий (в разведении 1 : 1 000000 и выше), риккетсий.
Сотрудниками Института биологической и медицинской химии Академии медицинских наук СССР получен синтетическим путем антибиотик левомицетин.
Левомицетин, который соответствует природному антибиотику хлоромицетину. Левомицетин является активным действующим началом антибиотика синтомицина. Спектр действия на бактерии левомицетина и синтомицина одинаков, но синтомицин менее активен, чем левомицетин. Эти антибиотики подавляют рост как грамотрицательных, так и грамположительных бактерий, риккетсий.
Тетрациклин. Получен из культур лучистых грибков. По своим свойствам во многом напоминает ауреомицин. Устойчив к кипячению, малотоксичен, не вызывает побочных явлений. Быстро всасывается из желудочно-кишечного тракта. С успехом применяется при острых тонзиллитах, отитах, бронхопневмонии, лимфаденитах, хроническом бронхите, лобарной пневмонии, при болезнях мочеполовой системы.
В последнее время из лучистых грибов получены новые антибиотики: эритромицин, олеандомицин, мономицин, канамицин и др.
Эритромицин и олеандомицин действуют главным образом на кокковую флору. Ценность этих
препаратов заключается в том, что они действуют на микроорганизмы, устойчивые к пенициллину.
Мономицин — обладает широким спектром антимикробного действия и бактерицидным свойством в отношении микробов, резистентных к другим антибиотикам.
К а н а м и ц и н — оказывает губительное действие па туберкулезные палочки и на штаммы стафилококка, устойчивые к другим антибиотикам.
Нистатин — извлечен из Streptomycesnoursci, широко применяется при лечении кандидозов.
Антибиотики животного происхождения. Л и з о ц и м. Антибиотик животного происхождения. Впервые был обнаружен в курином белке П. Лащенковым в 1909 г. Содержится в слезах, слюне, выделениях слизистых оболочек и различных органах. Обладает сильным растворяющим действием. Главным образом на сапрофитных микробов, а также на некоторые патогенные виды (гонококки, менингококки, гемолитический стрептококк, бациллы сибирской язвы, холерный вибрион).
Экмолин. Антибиотический препарат, полученный В. Ермольевой и сотрудниками из рыб. Этот препарат активен в отношении дизентерийиых и тифозных палочек, стафилококков, стрептококков, кишечной палочки.
Антибиотики растительного происхождения. Фитонциды. Наиболее изучены фитонциды лука и чеснока. Эти антибактериальные вещества изучены Б. П. Токиным. Они обладают высокой бактерицидной активностью в отношении стафилококков и дифтерийных палочек. Применяются для терапии протозойных заболеваний, трихомонадныхкольпитов, дизентерии и долго не заживающих ран.
Определение чувствительности микробов к антибиотикам. Лаборанту-микробиологу приходится не только выявлять наличие болезнетворных бактерий в присланном для исследования материале (кал, гной, слизь и т. д.), но и определять их чувствительность к различным антибиотикам.
Существует несколько методов определения чувствительности микробов к антибиотикам.
Метод серийных разведений. В штатив устанавливают 8 пробирок и в каждую из них, кроме первой, наливают по 1 мл бульона. В 1-ю и 2-ю пробирки вносят 1 мл раствора антибиотика, содержащего, например, 100 ЕД в 1 мл. Содержимое 2-й пробирки перемешивают л 1 мл переносят в 3-ю пробирку, из 3-й в 4-ю и так до 7-й пробирки, из которой удаляют 1 мл. Последняя пробирка является контрольной и не должна содержать антибиотика. Таким образом, 1-я пробирка будет содержать 100 ЕД антибиотика, 2-я—50 ЕД, 3-я— 25 ЕД и т. д. В каждую пробирку засевают по 1 петле испытуемой суточной бульонной культуры и опыт ставят в термостат при 37° на 24 часа, а затем производят учет. Предельное разведение антибиотика, при котором не обнаруживается видимого роста, является бактериостатической дозой.
Для определения бактерицидного действия из каждой пробирки делают высев на скошенный агар или секторами на мясо-пептонныйагар в чашки Гейденрейха— Петри. Через сутки пребывания посевов в термостате производится учет. Наименьшее количество антибиотика (наибольшее его разведение), которое вызывает гибель микробов, и будет его бактерицидной дозой (НДК — наименьшая действующая концентрация).
Метод бумажных дисков. Чашки заливают агаром и засевают равномерно всю его поверхность испытуемой культурой. Добавление к агару крови, сыворотки или углеводов не оказывает заметного влияния на результаты исследования. При определении же чувствительности микрофлоры мокроты при пневмонии следует пользоваться кровяным или сывороточным агаром. Если культура жидкая, то небольшое ее количество (1 мл 2-миллнардной суспензии по бактериальному стандарту) стерильно вносят в чашку и круговыми движениями распределяют по всей поверхности агара, избыток культуры сливают в дезинфицирующий раствор.
Чашки можно также засевать, нанося на поверхность агара непосредственно испытуемый материал (гной, мокрота, раневое отделяемое и т. п.). Нанесенный материал равномерно растирают по поверхности среды стерильным ватным тампоном или шпателем. Карандашом по стеклу дно чашки делят па несколько секторов соответственно количеству испытуемых антибиотиков. Затем стерильным пинцетом на каждый сектор накладывают бумажный диск, пропитанный раствором определенного антибиотика. Необходимо обращать особое внимание на то, чтобы на агар не было положено два соединенных между собой диска.
Диски раскладывают на равном расстоянии один от другого и на расстоянии 2 см от края чашки. Надписывать на дне чашки название антибиотика, которым пропитан диск, не обязательно, так как диски выпускаются разноцветными. Испытания с каждой культурой для большей достоверности результатов желательно ставить на двух чашках. Чашки выдерживают при комнатной температуре в течение часа, а затем помещают на 16—18 часов в термостат при 37°. Во избежание размывания зон конденсационной водой чашки рекомендуется ставить в термостат в перевернутом виде или же вкладывать под крышку чашки кружок фильтровальной бумаги.
Оценка результатов производится следующим образом: с помощью линейки определяют диаметр зон задержки роста микробов вокруг бумажных дисков (включая и диаметр самого диска). Отсутствие зоны задержки роста указывает па то, что испытуемый микроб нечувствителен к данному антибиотику. Зона диаметром в 15 мм является показателем малой чувствительности микроба к данному антибиотику, зона от 15 до 25 мм свидетельствует о том, что микроб чувствителен, а зона более 25 мм указывает на высокую чувствительность к антибиотику.

На рис. 47 видно, что наиболее сильнодействующими антибиотиками оказались стрептомицин и пенициллин, а слабым — биомицин.
В ряде лабораторий пользуются следующими методиками для определения чувствительности бактерий к антибиотикам.
Нативный материал (слизь, гной и т. д.) ополаскивают в 2—3 мл стерильного бульона. Пастеровской пипеткой несколько капель этого бульона вносят в чашку, шпателем распределяют его по всей поверхности arapa а затем накладывают диски. Иногда опыт не дает четких результатов. Поэтому остаток смыва ставят в термостат на 24 часа при температуре 37°. На следующий день определяют микрофлору, 0,1—0,2 мл культуры вносят в пробирку со стерильным бульоном и ставят в термостат на 4 часа, после чего 1 мл вносят в чашку с агаром и накладывают диски.
Патологический материал засевают на жидкую обогатительную среду (слизь из зева на сахарный бульон, мочу — на желчный бульон) и ставят в термостат на 24 часа. На следующий день определяют характер микрофлоры и в зависимости от этого по-разному ведут дальнейшее исследование.
Пример: В среде наблюдается рост стрептококка; 0,1—0,2 мл этой культуры вносят в пробирку с сахарным бульоном и ставят в термостат на 4 часа, после чего 1 мл переносят в чашку с сахарным или кровяным агаром и накладывают диски.
Часть нативного материала сразу засевают в чашку с кровянымагаром и накладывают диски, а остаток — на обогатительную среду. При отсутствии четких результатов на агаре дальнейшее исследование ведут с посевом на обогатительной среде.
По заданию клиники определяют чувствительность к антибиотикам каждого находящегося в патологическом материале микроба в отдельности. Тогда исследование задерживается, так как приходится сначала выделять чистые культуры бактерий, а затем проверять их чувствительность.

Сукцессия при росяной мочке льна (давали на бп как обязательное к запоминанию)
Бактерии – мукоров гр – темноокр гр – целлюлозоразлаг гр.
Под сукцессией понимают последовательные закономерные изменения в комплексе почв. МО и в происходящих микробиологических процессах независимо от того, приведут ли эти изменения (сукцессия) к установлению новой микробной системы или система вернется в первоначальное состояние. Сукцессионные изменения вполне закономерны, поэтому их можно предсказывать.
Инициированные микр. сукцессии – те, которые чем-то инициировали в лаб. условиях, да и не только (например, увлажнением, внесением глюкозы и проч.)
Звягинцев и Ко изучали сукцессии в лаборатории на чашках безумным количеством методов. И к чему пришли все эти люди:
Показателем, по которому можно судить о стадии микробной сукцессии в почве – коэффициент К. Он пригоден также при сравнении микробных сообществ в различных горизонтах почвенного профиля. Коэф. К колеблется от подстилки до верхнего почвенного горизонта от 10-15 до 200-300 и возрастает в нижних горизонтах до 1000-1300.
К=(М1+М0)/П1
М1+М0= П1+П2+П3+П4+П5…
М1-числ-ть бактерий, учитываемых прямым методом
М0-частиц, ошибочно учтенные как клетки
П1-бактерии, учтенные на опред.пит.среде (напр.МПА)
П2-бактерии, кот. Могут быть учтены на др.пит.средах
П3-медленнорастщие и неучитываемые по этой причине бактерии
П4-бактерии,кот.могут развиваться на использ.пит.среде, но не растут из-за стресса
П5-мертвые клетки, кот.учитываются при прямой микроскопии
Для зрелых сообществ К будет возрастать, для молодых – уменьшаться (растут или уменьшаются компоненты П). Поэтому высокое К характеризует поздние стадии микробной сукцессии, где преобладают МО с К-стратегией. Низкое значение К указывает на увеличение доли быстрорастущих бактерий (r-стратегов), что характерно для начальных этапов сукцессий. Короче, им можно определять стадии: например, после внесения глюкозы, его значение резко падает.
Теоретически возможны несколько типов сукцессий:
1. Числ-ть МО, учитываемых методом посева, растет на первых этапах сукцессии и постепенно падает на последующих при почти неизменной численности МО, учит.прямым методом. Более высокие значения К – в поздние сроки, низкие – в начальные. Снижение К в начальные сроки связано с падением разнообразия МО в системе, доминированием r-стратегов (быстроразвивающихся форм). Наблюдается в почвах, инициируемых увлажнением или внесением легкодоступного субстрата.
2. Числ-ть МО, учитываемых двумя методами в начальные сроки, возрастает, а затем сближается. В подобных системах «зрелые» стадии сукцессии вообще не достигаются. По этому типу идет сукцессия в ризоплане растений.
3. Учитываемая методом посева группа r-стратегов получает селективные преимущества в системе и становится главной, разнообразие в сообществе непрерывно падает, коэффициент К приближается к единице. Ситуация: основная масса бактерий подавляется введенным антибиотиком, а одна из групп бактерий (r-стратегов) является устойчивой к нему.
4. Селективное преимущество приобретает группа К-стратегов. Может происходить резкое падение численности всех групп МО, но учитываемая методом посева группа r-стратегов падает быстрее, чем общая численность. При этом общее разнообразие микробов в системе уменьшается, а К растет. Эта ситуация возникает при воздействии на экосистему экстремальных условий, когда преимущество получают устойчивые к экстремальным условиям формы (например, споры).
Про грибы: здесь фигурирует коэф. Z – отношение численностей, опред.прямым методом и методом посева (характеризует стадии грибной сукцессии в почве: возрастание в первые сутки = «омоложение» комплекса почвенных грибов, что связано с резким уменьшением числа спор)
Z=(a+b)/(a+c)=a/(a+c)+b/(a+c)
a - число обрывков живых гиф сахаролитических грибов
b - число нежизнеспособных гиф и грибов с иными пищевыми потребностями и низкими скоростями роста
с – число спор
a/(a+c) меньше 1, и поскольку значения Z намного единицу превышают им можно пренебречь => более простой вид уравнения
Z=(мертвые гифы+несахаролитические грибы+медленнорастущие грибы)/(споры+ живые гифы сахаролитических грибов)
Еще есть модель для колич.характеристики роста колоний мицелиальных МО, выделив в их строении две зоны: центральную и перифирическую (ω) (предложил Перт, 1967) Кr=µω
Кr-радиальная скорость роста колонии, которая определяется изменением радиуса колонии за единицу времени
µ-удельная скорость роста
ω-ширина зоны активного роста колонии
Кr – весьма чувствителен в к варьированияю условий среды и характеризует изменения комплекса почвенных грибов во времени.
Показатели К, Z и Кr – наиболее важные колич. Критерии, позволяющ. регистрировать сукцесионные изменения в комплексе почв. МО. Благодаря им возможно показать, что после внесения различ.орг.в-в в одной и той же почве могут складываться сообщества различной степени зрелости. Глюкоза создает наиболее незрелую стадию, целлюлоза – зрелую.
Изменения в составе МО связаны с тем, что почва как среда обитания постоянно меняется во времени (свойства, источники питания, условия и проч.). В каждый данный момент времени колич.состав микробов отражает историю развития МО в почве за предыдущий период.
3. Основы биологической систематики.
Содержание.
1. Современные направления в систематике прокариот
2. Полифазная таксономия
3. Основные филумы домена Bacteria и Archaea, обнаруживающиеся в почве
1. Современные направления в систематике прокариот.
Современные направления в систематике прокариот
Полифазный подход — комбинация хемотаксономических, фенотипических и генетических признаков (конгруэнтность). Только 16sРНК не служит показателем.
Анализ последовательности гена 16sРНК — 97% один вид, 70% ДНК-ДНК- гибридизации.
Фенотипический подход — температурные характеристики, рН, соли, кислород, окраска по Граму, скорость роста. Физиология и биохимия. Определение полярных липидов клеточной стенки, структура пептидогликана. MALDI-TOF; ICR-FT\MS (полно-циклотронный? Резонанс), Рамановская спектроскопия
Генетические методы — ДНК-ДНК гибридизация, мол% ГЦ
Типы систематических признаков:
|
Генотипический метод является доминирующим в полифазной таксономии. Он основан на изучении Ц+Г состава ДНК, на исследовании ДНК-рРНК гомологии, на установлении родственных отношений между микроорганизмами, которые закодированы в нуклеотидных последовательностях генов 16S или 23S р-РНК. Например, при определении принадлежности микроорганизма к определенному виду уровень сходства нуклеотидных последовательностей ДНК около 70% играет первостепенную роль. Поэтому генотипический метод часто называют методом геномной дактилоскопии. Фенотипические исследования используются чаще всего в различных схемах идентификации микроорганизмов, для формального описания таксона, от разновидности и подвида до рода и семейства. В то время как генотипические данные необходимы для размещения таксона на филогенетическом древе и в системе классификации, фенотипическая характеристика дает описательную информацию, позволяющую идентифицировать тот или иной вид микроорганизма. Классические фенотипические характеристики включают в себя морфологические, физиологические, биохимические, хемотаксономические и серологические особенности микроорганизмов. Морфологические признаки указывают, какие размеры и форму имеет микроорганизм (кокк, палочка, спирилла), есть ли у него капсула или споры, объединяются ли клетки в цепочки, тетрады или пакеты, есть ли у них жгутики и как они расположены, окрашиваются ли клетки по Граму. Морфология бактерий включает в себя изучение культуральных свойств, т.е. характер роста на питательных средах, форму колоний на плотных питательных средах, пигментообразование. Физиологические особенности характеризуют механизм обмена веществ, способ получения энергия, способность данного микроорганизма к трансформации тех или иных веществ, его отношение к углероду, азоту, кислороду, температуре, рН среды. Биохимические признаки определяются способностью микроорганизмов разлагать определенные сахара, образовывать сероводород, аммиак и другие соединения. Хемотаксономические особенности характеризуют химический состав цитоплазмы клетки. Таксономическая специфичность состава жирных кислот, липопротеидов, липополисахаридов, пигментов, полиаминов, белков и других химических компонентов клетки широко используется при классификации микроорганизмов. Серологические свойства, или серотипирование, основаны на выявлении вариабильности антигенных компонентов бактериальных клеток. Такими компонентами могут быть жгутики, фимбрии. капсулы, клеточная стенка, ферменты и токсины. Для выявления антигенных свойств бактериальной клетки используются различные серологические реакции: реакция преципитации, реакция склеивания комплемента, осаждение и др. Таким образом, фенотипические характеристики отличаются большим объемом и разнообразием получаемой информации, которую сложно обработать вручную. Возникла необходимость в компьютерном, числовом анализе получаемых данных. Появилась нумерическая (числовая) таксономия, позволяющая с помощью компьютерных программ анализировать фенотипические и генотипические характеристики микроорганизмов. Использование нумерического анализа в таксономической практике получило название «компьютерная идентификация». Филогенетические методы (от греч. phylon - род, племя и genesis - происхождение, возникновение) позволяют проследить процесс исторического развития микроорганизмов как в целом, так и их отдельных таксономических групп: видов, подвидов, родов, семейств, подпорядков, порядков, подклассов, классов, царств и доменов. Филогенетические связи между микроорганизмами изучаются методами геномной дактилоскопии, молекулярной биологии, компьютерной идентификации. На основании полученных данных строятся филогенетические древа, которые отражают эволюционные взаимоотношения между микроорганизмами (рис. 3). Создаваемые филогенетические древа не могут быть использованы для построения иерархической классификации микроорганизмов и не заменяют собою систематику. Они являются одним из ее элементов. |