Материал: Каминская Л.А.. Биоорганическая химия. Справочник-Словарь основных терминов и понятий

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

У

Углеводы. Общий класс органических соединений, к которым относятся полигидроксикарбонильные соединения и их производные. В зависимости от числа

остатков (звеньев) выделяют три группы: моносахариды

, олигосахариды (до10 –

звеньев) и полисахариды.

Формула Cn(H2O)m не

всегда соответствует из-за

существования аминосахаров, уроновых кислот,гетерополисахаридов.(

см.)

Углеродный скелет. «Остов» органической молекулы, основная последовательность соединенных друг с другом атомов углерода.

УДФглюкуроновая кислота (см. Глюкуроновая кислота,Нуклеотиды).

Уксусная кислота (см Карбоновые кислоты гомологического ряда).

Ураты. Соли мочевой кислоты.

Урацил С4Н4N2О2.

 

Пиримидиновое

азотистое основание. Бесцветные

кристаллы,лучше растворим в горячей воде,плохов

спирте.

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

NH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

 

O

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

Характерна лактимлактамная таутомерия: полный лактам(2, 6 - диоксопиримидин), в лактимной форме имеет только одну константу ионизации. Образует соли со связями кислород-металл (активные металлы) и азот-металл (малоактивные металлы). С формальдегидом образует5оксиметильные производные (в это же положение in vivo при синтезе тимина из урацилапоступает метильная группа, которую переносит витамин В12 от S-аденозилметионина). Урацил присутствует во всех видах РНК, в момент транскрипции и трансляции комплементарен аденину. Нуклеотид УТФ участвует в синтезе гликогена, превращении галактозо – 6 - фосфата в глюкозо – 6 – фосфат. УДФ -глюкуроновая кислота необходима для образования глюкуронидов при обезвреживании ксенобиотиков и билирубина.

181

Уровни организации белковой молекулы Различают 4вида структурной организации: первичная , вторичная, третичная, четвертичная. Первичная - уникальная цепная последовательность аминокислот, соединенных пептидными связями. Вторичная -организация первичной пептидной цепи в пространстве( а - спираль). Третичная – пространственная конфигурация вторичной структуры (глобула, β -структура, сверхспираль). Четвертичная -надмолекулярный комплекс нескольких субъединиц с определенной третичной структурой. см( . Вторичная структура,Третичная структура)

Ф

Фенантрен С 14Н10. Изомер антрацена, ароматическое конденсированное соединение, нелинейное строение, Т плавл. 101 0С, пластинки, нерастворим в воде, растворим в бензоле, хлороформе, умеренно в этаноле. Растворы обладают голубой флуоресценцией.

Ароматическая система содержит 14 π -электронов, неравномерное распределение электронной плотности, разные длины связей. Циклическая структура фенантрена присутствует в составе холестерина и его производных: желчных кислот, стероидных гормонов - половых , минералокортикоидов, глюкокортикоидов.

Фенил (греч.-phainǒ-освещаю). Название

частицы, радикала С

Н -

 

6

5

(например, С 6Н5-СН2-СООН -фенилэтановая кислота,или фенилуксусная кислота).

Фенилкетонурия - тяжелое нследственное заболевание, связанное с полным или частичным превращением незаменимой аминокислоты фенилаланина в тирозин. В крови накапливаются патологические продукты обмена - фенилмолочная и фенилпировиноградная кислота, фенилэтиламин, которые вследствие некоторого структурного сходства выступают ингибиторами при биосинтезе нейромедиаторов (дофамина, норадреналина, серотонина).Недостаток тирозина сопровождается снижением синтеза тиреоидных гормонов. Диагностируют по накоплению в крови фенилаланина и пояфлению в моче фенилпировиноградной кислоты (качественная реакция с FeCl3 на присутствие енольного гидроксила). При заболеваниях печени, в

пожилом возрасте также может наблюдатяся нарушение обмена фенилаланина.

182

Фенилпировиноградная кислота(3- фенил-2-оксопропановая кислота).

Оксо (кетоно)кислота, твердое кристаллическое вещество, пластинки, Т пл-1570 (с разложением), плохо растворим в воде, патологическое для организма человека соединение

С 6Н5-СН2-С(О) –СООН ↔ С6Н5- СН=С (ОН) –СООН

оксо(кето)форма

енольная форма

Химические свойства типичные для кетокислот.

Наличие енольной формы

положено в основу качественной реакии обнаружения (см.Фенилкетонурия )

Фенол (геч.-phainǒ -освещаю+ ol( eum) -

масло) С6Н5ОН (устаревшее название-

карболовая кислота). Бесцветные, розовеющие на воздухе кристаллы с характерным «фенольным» запахом. Хорошо растворим в спирте, ацетоне, бензоле, хлороформе. В 100 г воды при температуре 150С растворяется 8,2 г. Обладает слабыми кислотными свойствами, но слабее угольной кислоты. Образует соли с сильными основаниями, фенолят натрия и калия хорошо растворимы в воде, их присутствие в воде, особенно в питьевых источниках, недопустимо. Гидроксигруппа вследствие сильного +М эффекта активирует положения 2,4,6- бензольного цикла и облегчает реакции электрофильного замещения. При действии бромной воды образуется 2,4,6 – трибромфенол, при нитровании - 2,4,6 -тринитрофенол (пикриновая кислота). При действии СО2 в щелочной среде превращается в салициловую кислоту (реакция КольбеШмидта). Качественная реакция, позволяющая обнаружить фенол и другие соединения, содержащие енольный гидроксил, заключается в действии хлорида железа(+3), развивается фиолетовая окраска Высокотоксичен при попадании внутрь и при наружном воздействии. Обладает способностью денатурировать белки, на коже вызывает сильные ожоги. При воздействии на большие поверхности кожи возможен смертельный исход. Из организма удаляется после конъюгации с глюкуроновой кислотой. При наличии в воде следов фенола и хлора легко образуется 2-хлорфенол. Из двух молекул 2-хлорфенола при повышенной температуре получается диоксин, сильнейший канцероген, вызывающий изменения в генетическом аппарате половых и соматических клеток (мутаген и тератоген- греч.- teras- чудовище, урод). Фенольный цикл присутствует в аминокислоте тирозине. В организме человека из тирозина синтезируются адреналин , норадреналин, гидрохинон, которые являются полифенолами, т.е. содержат несколько гидроксигрупп в бензольном цикле. Представителем полифенолов являются гидрохинон, галловая кислота (см. Аминокислоты, Глюкуроновая кислота, УДФ-глюкуроновая кислота,Качественные реакции,Электрофильные реакции)

183

Ферменты (энзимы). Высокоспециализированные белки, по составу могут быть простые и сложные (последние содержат небелковую молекулу кофермент). Катализируют реакции in vivo, которые классифицируют на 6классов : 1 –

оксидоредуктазы, 2-

трансферазы, 3-гидролазы,

4

лиазы-

,

5

изомеразы-

,

6

-синтетазы (лигазы). Для каждого фермента

есть

свой шифр, состоящий из

4

разрядов. Первый разряд – указываеттип

реакции(

КФ 5 . . .фермент-

класса

изомеразы). В третичной структуре белка-фермента

выделяют

особый

участок

«активный центр», который сначала связывает вещество –субстрат

(субстратный

участок), затем включается каталитический участок, где осуществляется химическая реакция. Оба участка действуют кооперативно. В простом белке– ферменте оба участка образованы радикалами аминокислот, в сложном белке-ферменте в каталитическом центре присутствует небелковое вещество кофермент.

Ферментативные функции зависят от пространственной конфигурации третичной или четвертичной структуры, поэтому все факторы денатурации снижают

активность фермента. Незначительные изменения в третичной

структуре лежат

в основе аллостерической регуляцииактивности

фермента.

 

Фибриллярный белок ( лат.-fibra –волокно, уменьшит.- fibrilla

). Природные

белки, пространственное строение отличается отношением длины к ширине более 10. Обычно плохо растворимы или нерастворимы в воде. Представляют собой палочки или длинные нити. Длинные нити обычно имеют большую долю β - структуры по сравнению со спиральными участками а - структуры. Типичным фибриллярным белком является фиброин шелка, выделяемый особыми железами шелкового шелкопряда. Беспрепятственное образование вытянутых цепей и β - структуры возможно только для полиглицина. Образование фибриллярного белка фибрина наблюдается при превращении глобулярного белка фибриногена в фибрин под действием тромбина при активации свертывающей системы крови. Фибриноген представляет собой шарики, соединенные стержнями. Фибрин - поперечнополосатые фибриллы, полимеризуются и образуют сгусток, препятствующий кровотечению. Фибринашел применение в хирургии в виде пленок для закрывания дефектов мозговых оболочек, для остановки кровотечения. Самый распространенный белок организма коллаген имеет фибриллярное строение

(см.Коллаген ).

Флуоресценция ( см.Люминесценция).

Фолдинг. Формирование трехмерной (третичной) структуры белка синтезируемой полипептидной цепи с участием белков -шаперонов (см.Шапероны )

Фолиевая кислота (см.Витамины).

184

Формалин. Стандартный водный раствор формальдегида. Содержит (массовые доли %): формальдегида 37 -37,3, метанола 6 -15,муравьиной кислоты 0,02-0,05. Хранят плотно закрытым при пониженной температуре во избежание удаления растворенного формальдегида и образования побочных продуктов. При длительном хранении образуется ацеталь метилаль. Возможно выпадение небольшрго количества твердого полимера параформа (СН2О)n. В медицине применяют для приготовления анатомических препаратов, бальзамирования, очень разбавленный раствор использовали для дезинфекции, в стоматологии при депульпировании.

Фосфатидовая (фосфатидная) кислота (1, 2- диацил-sn-глицеро-3- фосфат; L-а-фосфатидная кислота). Предшественник в синтезе фосфатидов и триглицеридов. В клетках не накапливается, содержится в незначительных (следовых) количествах. При гидролизе в щелочной среде образуется фосфоглицерин и соли двух высших карбоновых кислот.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H2C

 

 

O

 

 

 

 

R1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R2

 

C

 

 

O

 

 

CH

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H2C

 

 

O

 

P

 

 

 

O

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

 

 

 

Фосфатиды ( см.Фосфолипиды).

Фосфоаденозилфосфосульфат (ФАФС). Аденозил -3'-фосфат- 5'-фосфосульфат или 3'фосфоаденозил– -5'-фосфосульфат. Нуклеотид, содержит два остатка фосфорной кислоты в положениях 3',5' рибофуранозного цикла, остаток фосфата в положении в положении5' связан с сульфогруппой (эта связь макроэргическая). Источником сульфогруппы является атом серы цистеина в составе тиольной (меркапто)группы.

 

 

O

 

OH

 

 

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

HO

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

S

 

 

P

 

O

N

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2

O

N

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H H

H H OPO3H2 OH

185

Источник: https://studfile.net/preview/16473391/