Глава 2. Микробиологическая диагностика инфекционных заб олеваний
комендуется проводить через каждые 48 ч на шоколадном агаре путем инкубации посевов в течение 18—24 ч или использовать флаконы с двухфазной средой. Истинные патогены могут быть отдифференцированы от контаминантов, если имеет место:
рост одного и того же микроорганизма в двух флаконах при посеве проб крови от одного пациента, взятых с интервалом во времени;
обнаружение одного и того же микроорганизма в посевах двух и более проб крови;
рост микроорганизма в течение 48 ч;
проявление одинаковых свойств и чувствительности к антибиотикам у разных изолятов, полученных из одной пробы крови;
выделение двух и более микробов, что может свидетельствовать как о поли-
микробной бактериемии, так и о контаминации проáû.
Определение чувствительности культур к антибиотикам
Для определения чувствительности к антибиотикам энтеробактерий и стафилококков обычно используют метод Керби — Бауэра. Для определения чувствительности к антибиотикам (для количественного определения минимальной подавляющей концентрации) стрептококков (в т.ч. пневмококков), не ферментирующих грамотрицательные палочки, а также гемофильной палочки и дрожжеподобных грибов рекомендуется использовать коммерческие тест-системы ("стрипы").
Инфекции органов дыхания
Основные образцы исследования. Характеристика нормальной микрофлоры глотки
Основными образцами для исследований являются мазки из носа, носоглотки, зева, а также мокрота и промывные воды бронхов. Значительно реже проводят исследования биоптатов легких, аспиратов из максиллярных синусов, трахеи и прочих образцов. Нормальная микрофлора глотки включает в себя:
альфа-гемолитические стрептококки;
непатогенные нейссерии;
M. catarrhalis (может быть возбудителем инфекции дыхательных путей);
стафилококки (S. aureus, S. epidermidis);
дифтероиды;
гемофильные бактерии;
дрожжи (в ограниченном количестве);
различные, исключительно анаэробные, грамположительные кокки (и грамотрицательные палочки спиралеобразной и волокнистой формы);
энтеробактерии и неферментирующие грамотрицательные бактерии (у пациентов в преклонном возрасте, при иммунодефиците, при антибиотикотерапии).
|
|
|
|
Тампон + |
|
|
|
Бактериоскопия |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
транспортная среда |
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
ÊÀ |
ÆÑÀ |
ØÀ |
ÑÑ |
||||


Определение Бактериоскопия Идентификация чувствительности
к антибиотикам
Рисунок 7. Схема бактериологических исследований отделяемого из верхних отделов дыхательных путей
Обозначения: КА — кровяной агар; ЖСА — желточно-солевой (маннито-солевой) агар; ША — шоколадный агар; СС — среда Сабуро (грибы)
55
ВВЕДЕНИЕ
Исследуемым материалом из верхних дыхательных путей является отделяемое носа, носоглотки и зева, забираемое с помощью ватных тампонов. На рисунке 7 приведена схема бактериологического исследования отделяемого из верхних дыхательных путей.
Правила взятия мазков для посева на флору и чувствительность к антибиотикам
1. Слизь из носа:
обмыть крылья носа стерильным физиологическим раствором. Материал забирать стерильным ватным тампоном из передних отделов носа, отдельно из правой и левой ноздри, избегая контакта тампона с кожей носа;
тампон поместить в пробирку (с транспортной средой или без нее) и в течение 1 часа доставить в баклабораторию.
2. Слизь из зева:
натощак до гигиенической обработки полости рта или через 2 часа после еды. Для взятия мазка стерильным ватным тампоном провести по задней стенке глотки и миндалинам, избегая кон-
такта тампона со слизистой оболочкой полости рта и языка. При наличии налета стараться снять его часть. Далее см. п.1.
Заметим, что нижние отделы дыхательных путей в норме обычно не содержат бактерий. На рисунке 8 приведена схема бактериологического исследования отделяемого из нижних отделов дыхательных путей.
Исследуемым материалом из нижних отделов дыхательных путей являются:
мокрота;
содержимое бронхов (лаваж), щеточные соскобы (brushings);
аспираты и пунктаты из трахеи;
легочная ткань (пункция и/или биопсия).
Мокрота может быть контаминирована нормальной микрофлорой верхних дыхательных путей. Время проведения микробиологического исследования: 4 — 5 дней.
При оценке результатов принимают во внимание следующие показатели:
содержание в бронхоальвеолярном лава-
же (БАЛ) определенного вида микроорганизмов — в количестве ³104 ÊÎÅ/ìë;
содержание при бронхиальной браш-
биопсии определенного вида микроорганизмов — в количестве ³103 ÊÎÅ/ìë;
|
|
Стерильный контейнер |
|
Бактериоскопия |
|
|
с образцом |
|
|
ÊÀ |
ÆÑÀ |
ÑÝ |
ØÀ |
ÑÑ |
|
ÑÌ |
ÑË |
ÐÈÔ |
|
Бактериоскопия |
|
Идентификация |
|
Определение |
|
|
чувствительности |
||
|
|
|
|
к антибиотикам |
Рисунок 8. Схема бактериологического исследования отделя емого из нижних отделов |
||||
дыхательных путей |
|
|
|
|
Обозначения:КА — кровяной агар; ЖСА — желточно-солевой (маннито-солевой) агар; СЭ — среда для энтеробактерий; ША — шоколадный агар; СС — среда Сабуро (грибы); СМ — среда для микобактерий; СЛ — среда для легионелл; РИФ — реакция иммунофлюоресценции (вирусы)
56
Глава 2. Микробиологическая диагностика инфекционных заб олеваний
содержание в мокроте определенного вида микроорганизма — в количестве 106—
107 ÊÎÅ/ìë.
Определенное значение имеет вид выделенного микроорганизма. Так, альфа-гемо- литические стрептококки, коагулазонегативные стафилококки, дифтероиды и нейссерии (кроме возбудителей дифтерии и менингита) учитываются только при СПИД/ВИЧ-ассоциированных инфекциях, нейтропении и онкологических заболеваниях.
Взятие мокроты необходимо производить до еды, после полоскания зева и полости рта теплой водой или раствором питьевой соды (1 чайная ложка на стакан воды). Мокроту при свободном откашливании (лучше — первую утреннюю порцию) собрать в стерильный контейнер с крышкой. Если мокрота отделяется плохо, то следует накануне дать пациенту отхаркивающие средства. Правильно собранная мокрота является гнойной или слизис- то-гнойной, с прожилками крови (иногда также — с зелеными включениями).
Характерными признаками неправильно собранной мокроты являются:
серый и белый цвет (слизистый или пенистый характер);
белый цвет, наличие частиц пищи;
водянистость.
При выявлении перечисленных признаков сбор мокроты следует повторить.
Микроскопическоеисследование биоматериала. Диагностика
Собранную мокроту в дальнейшем подвергают микроскопическому исследованию. С этой целью пробу мокроты используют для приготовления мазка, который окрашивают по Граму. При обнаружении в пробе лишь эпителиальных клеток (секрет ротовой полости и глотки) культивирование образцов не проводится. Не следует также проводить посев образцов мокроты, мазки которой содержат (при 100-кратном увеличении микроскопа) менее 25 полиморфноядерных нейтрофилов и больше 10 эпителиальных клеток в поле зрения.
Диагностику легионеллы следует производить реакцией иммунофлюоресценции (РИФ) на определение антигена. Диагностику микоплазмы — иммуноферментным анализом (ИФА), выявляющим IgG , IgM. При диагностике хламидии диагностируются как РИФ, так и ИФА — антигены и антитела (IgG).
Определение чувствительности выделенных культур микроорганизмов к антибиотикам проводится аналогично методам в гемокультуре.
Инфекции системы органов пищеварения
Характеристика микрофлоры кишечника.
Материалы для исследований
Для пищеварительной системы характерно распределение микрофлоры: так, в ротовой полости наблюдается ее многообразие, убывающее от пищевода к тонкой кишке. Обширная колонизация отмечается также в толстой кишке, где сосредоточена большая часть всей микрофлоры организма. Однако воспалительные процессы в органах пищеварения могут быть вызваны и представителями нормальной кишечной микрофлоры и внешними патогенами. В качестве исследуемого материала могут
использоваться:
рвотные массы;
промывные воды;
отделяемое желудка (фиброгастроскопия);
отделяемое тонкой кишки;
желчь;
фекалии.
Порядок оценки результатов
Оценка результатов производится в зависимости от вида исследуемого материала. Так, при исследовании желчи прогностически неблагоприятным считается выделение различных энтеробактерий (чаще других —
57
ВВЕДЕНИЕ |
|
|
|
|
|
|
|
Стерильныйконтейнер |
|
Бактериоскопия |
|||
|
|
с образцом |
|
|
|
|
ÑÕÂ |
ÑÅ |
ÑÑ |
ÑÊ |
ÑÊÏ |
ÑÍÁ |
ÑÊ |
Средыдляшигелл |
|
ÆÑÀ |
|
ÐÈÔ |
|
|
и сальмонелл |
|
|
|
|
|
|
Бактериоскопия |
|
Идентификация |
|
Определение |
||
|
|
чувствительности |
||||
|
|
|
|
|
к антибиотикам |
|
Рисунок 9. Схема бактериологического исследования отделя емого из желудочно-кишечного |
||||||
тракта |
|
|
|
|
|
|
Обозначения: СЕ — среда для йерсиний; СК — среда для кампило- и хеликобактера; СКП — среда для кишечной |
||||||
палочки; СК — среда для клостридий; СХВ — среда для холерного вибриона; ЖСА — желточно-солевой (манни- |
||||||
то-солевой) агар; СС — среда Сабуро (грибы); СНБ — среда для неферментирующих грамотрицательных бакте- |
||||||
рий; РИФ — реакция иммунофлюоресценции (вирусы) |
|
|
|
|
||
эшерихий, клебсиелл, протея, синегнойной |
|
молочно-кислого брожения (кефир, тво- |
||
палочки, бактероидов в количестве > 103 |
|
ðîã è äð.). |
||
ÊÎÅ/ìë). Íà рисунке 9 приведена схема бак- |
Отделяемое брюшной полости: |
|||
териологического исследования при инфек- |
собрать на стерильный ватный тампон |
|||
ционных поражениях органов пищеварения. |
|
или в стерильный шприц; |
||
|
Время проведения исследования до полу- |
|
материал поместить в стерильную про- |
|
чения отрицательного результата может со- |
|
бирку и доставить в баклабораторию. |
||
ставлять от 24 часов до 5 дней. |
Отделяемое (или промывные воды) же- |
|||
|
|
|
лудка или тонкой кишки: |
|
|
|
|
|
получить при фиброгастроскопии или |
Правила взятия отделяемого |
|
|||
|
специальными зондами; |
|||
пищеварительного тракта |
|
|||
|
материал поместить в стерильную про- |
|||
для бактериологического |
|
бирку с физиологическим раствором и |
||
исследования |
|
|
||
|
доставить в баклабораторию. |
|||
Желчь: |
|
|||
Фекалии: |
||||
|
проводить дуоденальное зондирование; |
|
собрать в чистое судно без дезинфици- |
|
|
порции А, В, С собрать раздельно в сте- |
|
рующих веществ; |
|
|
рильные пробирки с соблюдением правил |
стерильной палочкой не более 1 грамма |
||
|
асептики и доставить в баклабораторию; |
|
фекалий сразу после акта дефекации пе- |
|
|
накануне исключить из рациона питания |
|
ренести в стерильный контейнер с крыш- |
|
|
обследуемого продукты дрожжевого и |
|
кой и доставить в баклабораторию. |
|
Инфекции мочевыводящих путей
Основные возбудители инфекций
Моча здорового человека, как правило, стерильна. Бактерии проникают в нее при прохождении через дистальные отделы мочевы-
водящих путей. Инфекции могут вызывать:
стафилококки;
энтерококки;
энтеробактерии;
псевдомонады;
микобактерии;
58
Глава 2. Микробиологическая диагностика инфекционных заб олеваний
Бактериоскопия
Стерильный контейнер с образцом
ÕÑ |
ÊÀ |
ÑÌ |
|
|
|


Определение Бактериоскопия Идентификация чувствительности
к антибиотикам
Рисунок 10. Схема бактериологического исследования мочи
Обозначения: ХС — хромогенные среды для выделения кишечной палочки, протея и других энтеробактерий, энтерококков, неферментирующих грамотрицательных бактерий, стафилококков и грибов; КА — кровяной агар для культивирования стрептококков, коринебактерий и гардне релл; СМ — среда для микобактерий
микоплазмы;
грибы и фузиформные бактерии.
Обилие микроорганизмов, колонизирующих наружные половые органы и переднюю уретру, а также способных быстро размножаться в моче, осложняет правильную интерпретацию результатов бактериологического исследования. Отметим, что женщины более склонны к инфицированию мочевого тракта, при этом взятие проб мочи для исследования у них также представляет большие сложности.
В моче 10% пациентов с инфекциями мо- чевыводящих путей могут присутствовать два микроорганизма, каждый из которых может рассматриваться как возбудитель заболевания. Наличие в образце мочи трех и более различных микроорганизмов свидетельствует, как правило, об ошибках при взятии проб мочи или последующих манипуляциях (за исключением случаев, когда имеется постоянный катетер мочевого пузыря). Исследованию подвергается моча, полученная неинвазивным и инвазивным (надлобковая пункция мочевого пузыря, катетеризация мочевого пузыря) методами. На рисунке 10 представлена схема бактериологического исследования мочи.
Основные этапы исследования мочи. Оценка результатов
Бактериологическое исследование мочи включает следующие этапы:
мазки с окраской по Граму;
микроскопию мазка (скрининг);
культивирование проб мочи;
определение чувствительности к антибиотикам для клинически значимых культур.
Âнорме моча человека, полученная неинвазивным путем, может быть контаминирована нормальной микрофлорой из дистальных отделов мочевыводящих путей и кожи промежности. Время проведения исследования до получения отрицательного результата составляет 24—72 ÷àñà.
Выявление одной и более бактериальных клеток в поле зрения микроскопа свидетельствует о наличии в 1 мл мочи 105 и более микроорганизмов. Выявление одного и более лейкоцитов в поле зрения микроскопа является индикатором инфекции. Подчеркнем, что в мазке мочи здорового человека допускается наличие лишь нескольких бактериальных клеток или лейкоцитов.
Âмазках мочи, взятой у женщин, нали- чие большого числа слущенного эпителия, независимо от того, обнаружены или не обнаружены бактерии, свидетельствует о контаминации мочи влагалищной флорой, в связи с чем необходимо повторение анализа. При интерпретации результатов учитываются:
степень бактериурии (см. Общие рекомендации по оценке результатов тестов мочи);
вид выделенного микроорганизма;
повторность его выделения в процессе заболевания;
59