Уточнение структуры и структурная информация |
167 |
прямой линии; кроме того, энгармонизм потенциаль ной функции колебания приводит к тому, что движе ние от положения равновесия будет более пологим в одну сторону, чем в другую. Чтобы проанализиро вать такое движение, необходимы наилучшие совре менные данные. Существует немало примеров опре деления кристаллической структуры, в которых даже такая упрощенная модель, как эллипсоидальная, на самом деле является неоправданной просто потому, что данные по интенсивностям не были достаточно качественными. «Колебательные параметры», полу ченные на основе этих данных, по крайней мере ча стично являются артефактами; в частности, ложная анизотропия движения некоторых атомов структуры может быть следствием пренебрежения поправками на поглощение в кристалле нерегулярной формы. Однако, используя подходящее излучение, а также кристалл с соответствующими размерами и формой, можно либо оценить, либо свести к минимуму ошиб ки, связанные с таким поглощением. Когда же это сделано и из рентгенографических данных получены параметры анизотропии движения атомов (а это де лается лишь в лучших работах), то найденная таким способом анизотропия должна отражать действитель ность.
Движение молекул как целого. Некоторые моле кулы приближенно можно рассматривать как твердые тела, т. е. считать, что при их движении относитель ные положения всех атомов (а следовательно, и все межатомные расстояния) остаются неизменными. Та ким образом, можно считать, что молекулы движутся как целое. Конечно, это всего лишь приближение, поскольку «внутренние» колебания —движение како го-нибудь атома в молекуле по отношению к его со седям — всегда имеют место, однако во многих крикристаллах движение целых молекул (или ионов) много больше внутренних колебаний. Анализ отдель ных анизотропных параметров температурного фак тора молекул в кристаллах обнаруживает иногда не которые интересные свойства молекулярного движе ния, которые часто удается скоррелировать с формой
168 |
Часть III |
■молекулы |
и с природой ее окружения в кристалле. |
•Движение молекулы, вообще говоря, можно описать в терминах трех компонентов: трансляционного дви жения (колебания по прямой линии), либрационного
•движения (колебания по дуге), а также комбинацией трансляционного и либрационного движений, которую можно рассматривать как колебание по спирали. Не которые молекулы, не являющиеся вполне жесткими, можно считать состоящими из жестких сегментов, соединенных нежесткими связями. К ним относятся такие молекулы, как дифенил и его производные, в которых торсионные колебания вокруг связи между кольцами очень велики. Методы анализа молекуляр ного движения в таких молекулах, которые можно рассматривать как системы, построенные из жестких участков, в настоящее время успешно развиваются.
Одно важное свойство либрационного движения состоит в том, что внутримолекулярные расстояния
•кажутся несколько короче, чем они есть на самом деле; особенно это касается расстояний, перпендику лярных осям, около которых наблюдается существен ное либрационное движение. Если картина движения известна, то нетрудно найти приближенную поправку -к внутримолекулярным расстояниям, однако для не жестких молекул достаточно точных формул для та ких поправок не существует. Это еще один пример систематической ошибки, которая приводит к значи тельно меньшей точности полученного результата, чем точность, основанная на статистическом анализе и -предположении о случайности ошибок. Что же ка сается межмолекулярных расстояний, то при наличии существенного молекулярного движения для них мож но указать лишь весьма неопределенные пределы из- ■менения, ибо корреляция движения одной молекулы -с ее соседями неизвестна.
Дифракция нейтронов. Рентгено- и нейтронография
• во многих отношениях дополняют одна другую, по-
• скольку суть процесса в них различна. Рентгеновские
-лучи |
рассеиваются |
почти |
исключительно атомными |
|
-электронами, |
тогда |
как нейтроны рассеиваются ядра- |
||
•ми. |
Поэтому, |
если |
центр |
тяжести электронного рас |
Уточнение структуры и структурная информация |
169 |
пределения какого-либо атома не совпадает с поло жением его ядра, то положение атома, определяемое этими двумя методами, будет различаться. Это разли чие особенно заметно в положениях атомов водорода; в рентгеновских исследованиях связи, в которых уча ствуют атомы водорода, обычно кажутся на 0,1 А ко роче, чем они есть на самом деле, так как связанный атом водорода не имеет сферической симметрии, ха рактерной для внутренних электронных оболочек, — его единственный электрон смещен к атому, с которым связан данный атом водорода.
Рассеяние от ядер мало зависит от атомного но мера (или по крайней мере не зависит от него регу лярным образом). Этот факт можно использовать для выяснения некоторых неоднозначностей рентгено структурного исследования. Типичные значения рас сеивающего фактора для рентгеновских лучей и ней тронов приведены в приложении 10. Водород имеет отрицательный * рассеивающий фактор для нейтронов (см. рис. 37), тогда как дейтерий имеет положитель ный фактор, причем оба они достаточно велики, так что эти два изотопа легко можно различить; что же касается рентгеновских лучей, то для них эти изотопы одинаковы. Поэтому дифракцию нейтронов можно ис пользовать для изучения структур, которые были по мечены дейтерием. При помощи нейтронов можно также различить атомы с примерно одинаковыми атомными номерами, что невозможно установить рентгенографически (например, Fe, Со и N1), ибо для нейтронов их рассеивающая сила существенно раз лична. Нейтронографический анализ позволяет опре делить положения атома водорода или дейтерия с такой же точностью, как и положения урана и многих других тяжелых атомов. Это очень важное преиму щество нейтронографических исследований. Как и в случае рентгеновских лучей, для нейтронов также
* Если ядро имеет отрицательный рассеивающий фактор, то излучение, рассеянное этим ядром, отличается по фазе от излу чения, рассеянного ядром с положительным рассеивающим фак тором. (и занимающим, разумеется, то же положение), ровно на 180° (cos 180° = — 1).
170 |
Часть III |
может иметь место аномальное рассеяние. Поскольку ядра малы по сравнению с длинами волн обычного нейтроновского излучения (порядка 1А), то интен сивность нейтронов, рассеянных от стационарного
|
v |
|
|
V |
|
|
\ |
|
|
Ъ//Л |
|
' SNA \ ' |
|
||||
г |
' Л \ |
|
/ ' / / / |
||
\ |
* |
|
|
||
|
|
I 1 l ! l |
|||
J |
/1 /1 >1 |
,. |
' \ |
||
H I 1, |
|||||
|
|
I |
\ |
(Уу |
|
'- - А * '
сг!W |
o |
1) н)__ |
|
0 ш / |
\ ,V,v- |
W in |
/ |
/ |
< |
---. N» \ |
//// |
; |
1 |
к |
у , г , |
|
|
|
|
|
\Ч — |
Рис. 37. Плотность рассеяния нейтронов кристаллом, спроециро ванная на плоскость (001).
Положительная плотность (главным образом в положениях лтомов С) указана сплошными линиями, отрицательная плотность (главным образом в положениях атомов Н ) — пунктиром. Неме ченые атомы Н принадлежат другим молекулам бензола. Пло скость кольца не перпендикулярна к направлению проекции; по- -этому кольцо не кажется правильным шестиугольником.
•ядра, в отличие от интенсивности рентгеновских лучей заметно не уменьшается на больших углах. Однако ■так же, как и для рентгеновских лучей, колебания фатомов даже при низкой температуре должны приво
дить |
к уменьшению интенсивности на больших углах |
|
[рис. |
1 5 ( b ) ] . |
. . |
Уточнение структуры и структурная информация |
171 |
Сравнивая данные, полученные методом дифрак ции рентгеновских лучей и нейтронов, некоторые ис следователи получили недавно доказательство нали чия связывающих электронов. Один из недостатков нейтронографического метода заключается в том, что при его использовании необходимы кристаллы боль шего размера, чем для рентгеноструктурного анализа; при работе же с малыми кристаллами, если принять во внимание величину потока нейтронов, получаемую в современных реакторах, интенсивность дифрагиро ванных пучков будет недостаточной.
Исследования не полностью кристаллических стру ктур. Как уже было отмечено ранее, кристаллическое состояние характеризуется высокой степенью вну тренней упорядоченности. В жидкостях, газах, стекле, пластиках и многих других классах веществ строгого внутреннего порядка нет. В таких образцах наблю даются все возможные ориентации рассеивающей материн. Поэтому, несмотря на то что на таких мате риалах рентгеновские лучи или нейтроны дифраги руют, полученные дифракционные картины сфериче ски симметричны, а вся информация заключена в радиальном распределении (в результате становятся известными лишь межатомные расстояния, но не угло вое направление между этими расстояниями). При большой разрешающей силе, какой обладают совре менные электронографы, предназначенные для иссле дования структуры газовых молекул, одной лишь ра диальной информации может оказаться достаточно для полного структурного анализа при условии, что молекула достаточно проста и в ней имеется неболь шое число различных межатомных расстояний. Од нако чаще, особенно в случае конденсированных фаз, встречаются ситуации, когда имеется слишком много близких по величине расстояний, и несмотря на то, что они усреднены по всем направлениям, их тре буется разрешить. Следовательно, дифракционная картина от жидкостей, стекол и других аморфных ма териалов дает информацию о межатомных расстоя ниях лишь в том случае, если какое-либо одно рас стояние существенно выделяется среди всех других.
172 |
Часть III |
Это может произойти от того, что такое расстояние имеет достаточно большой вес: либо что оно встре чается намного чаще других; либо оно относится к атомам, факторы рассеяния которых велики по срав нению с факторами рассеяния других атомов. Кроме того, это может быть совершенно уникальное расстоя ние, которое не сравнимо по величине ни с каким другим расстоянием в этом образце. Тщательные ди фракционные исследования жидкостей дают очень важную информацию; примеры функций радиального
Уточнение структуры и структурная информация |
173 |
распределения, вычисленных для жидких образцов, приведены на рис. 38.
Дифракционная картина рис. 9 (стр. 46—47) иллю стрирует эффект частичного, но не полного порядка дифракционной картины. На рис. 9(г) достаточно от четливо виден результат одномерного внутреннего порядка (характерного для некоторых волокон); в случае одномерного порядка вместо пятен возникают удлиненные полосы. Многие волокна построены из звеньев со спиральными структурами, причем в них имеется определенный порядок вдоль оси спиралей, но может и не быть порядка в упаковке соседних спиральных звеньев. Такие структуры имеют ДНК, некоторые фибриллярные белки и многие другие есте ственные и синтетические вещества. На рис. 39 пока зано несколько рентгенограмм ДНК. Координаты
Рис. 38. Функции радиального распределения.
На рисунке приведены кривые радиального распределения, полученные в рентгеновских дифракционных исследованиях жидкой воды при температурах от 4 до 200 °С. До 100 °С давле ние в образце было равно атмосферному; выше 100 °С давление было равно давлению насыщенного пара. Вертикальная коорди ната кривых представляет собой нормированную радиальную функцию распределения, т. е. она дает информацию о числе со седних атомов или молекул, находящихся на расстоянии г от среднего атома или молекулы в данной жидкости, по сравнению с ожидаемым числом для жидкости без определенной структуры.
Пик около 1 А соответствует внутримолекулярному взаимо действию О—Н (ковалентной связи), а пик при 2,9 А — взаимо действию между атомами кислорода соседних молекул воды, Далее следуют широкие пики; в частности, четко выраженные пики при 4,5 и 7 А можно отнести к преимущественным расстоя ниям между второй и более высокими координационными сфе рами. При расстояниях больше атомных размеров, а также при повышении температуры значения G(r) стремятся к единице, т. е. к значению этой функции для бесструктурной жидкости.
В Жидкой воде средняя координация в первой сфере состав ляет около 4,4 молекулы (независимо от температуры). Если учесть, чтово льду это число в точности равно 4, то отсюда с неизбежностью следует, что при плавлении льда плотность воз растает благодаря незначительному увеличению среднего коорди национного числа в первой .координационной сфере. Другие детали кривых радиального распределения воды соответствуют прибли зительно тетраэдрической координации молекул, найденной во льду, -