Следовательно, среди обследованного населения положительный резус -фактор или 36% человек с генотипом СС и 48% - с генотипом Сс.
Решить задачи:
1.Дети, больные фенилкетонурией, рождаются с частотой 1:10000 новорожденных. Определите процент гетерозиготных носителей гена.
2.Альбинизм наследуется как аутосомно-рецессивный признак. Заболевание встречается с частотой 1:20000. Определите процент гомозиготных носителей гена.
3.Одна из форм фруктозурии наследуется как аутосомно-рецессивный признак и встречается с частотой 7:1000000. Определите частоту встречаемости гетерозигот в п о- пуляции.
4.Аниридия наследуется как аутосомно-доминантный признак и встречается с частотой 1:10000. Определите частоту встречаемости гетерозигот в популяции.
5.В большой по численности популяции частота гена дальтонизма (рецессивный, сцепленный с Х-хромосомой признак) среди мужчин составляет 0,08. Определите частоту встречаемости генотипов доминантных гомозигот, гетерозигот, рецессивных гомозигот у женщин данной популяции.
6.2.Ответить на контрольные вопросы.
7.Вопросы к контролям по данной теме:
7.1.Вопросы к текущим компьютерным контролям:
1.Популяционно-статистический метод применяется для:
а изучения наследования признаков в больших группах населения из одной или
нескольких популяций, в одном или нескольких поколениях; б исследования генетических закономерностей на близнецах;
в исследования закономерностей наследования признаков в нескольких поколениях;
гсоставления близнецовой выборки; д диагностики зиготности.
2.Первый этап популяционно-статистического метода:
а +выбор популяций, определение величины выборки, выбор генетических признаков;
б -сбор материала; в -статистический анализ;
г-составление близнецовой выборки;
д -диагностика зиготности.
3.Второй этап популяционно-статистического метода:
а -выбор популяций, определение величины выборки, выбор генетических призн а- ков;
б +сбор материала; в -статистический анализ;
г -составление близнецовой выборки;
76
д-диагностика зиготности.
4.Третий этап популяционно-статистического метода:
а -выбор популяций, определение величины выборки, выбор генетических призн а- ков;
б -сбор материала; в +статистический анализ;
г -составление близнецовой выборки;
д-диагностика зиготности.
5.В основе популяционно-статистического метода лежит:
а -сравнение изучаемых признаков в разных группах близнецов; б -изучение дерматоглифов; в -составление родословных;
г +применение закона генетической стабильности популяций Харди -Вайнберга;
д-диагностика зиготности.
6.Ошибки популяционно-статистического метода связаны: а +с недоучетом миграции населения; б -с недостаточным сбором данных истории жизни;
в -с ошибками при диагностике зиготности; г -с неучетом соматических мутаций;
д-с ни одним из вышеназванных пунктов.
7.Практическое применение закона Харди-Вайнберга:
а +позволяет определить генетическую структуру популяции; б -позволяет определить тип наследования признака с использованием анализир у-
ющего скрещивания; в -позволяет определить степень парной конкордантности;
г -позволяет определить степень парной дискордантности;
д-ни один из вышеназванных ответов.
8.Одной из характерных черт идеальной популяции является:
а -популяция, находящаяся в идеальных условиях существования; б -популяция с оптимальным соотношением аллелей; в +отсутствие действия элементарных эволюционных факторов; г -популяция с небольшой численностью особей;
д-популяция, в которой отсутствует панмиксия.
9.Какова частота доминантного аллеля в популяции, если q = 0,20:
а-0,20;
б-0,40;
в +0,80;
г-1,00;
д -ни один из вышеназванных ответов.
10.В исследуемой популяции частота доминантного гена составляет 0,4; рецессивного - 0,6; Определите процент гетерозиготных организмов:
а -12%;
77
б-24%;
в-36%;
г +48%;
д-52%.
7.2. Вопросы, включенные в билеты к курсовому экзамену:
1.Популяционно-статистический метод исследования. Определение. Этапы исследования. Закон Харди – Вайнберга и его положения. Условия действия закона. Практическое применение закона в генетике человека.
8.Литература для подготовки к занятию:
8.1.Основная:
8.1.1.Биология: учебник в 2-х т. / Под. ред Ярыгина В.Н. – М.: ГЭОТАР-Медиа,
2012.
8.2.Дополнительная:
8.2.1.Основы классической и медицинской генетики. Часть I. Учебное пособие для студентов. / О.Г. Макеев, В.А. Буханцев, О.И. Кабонина. Екатеринбург, 2015.
8.2.2Основы классической и медицинской генетики. Часть II. Учебное пособие для студентов. / О.Г. Макеев, В.А. Буханцев, С.В. Костюкова, О.И. Кабонина. Екат е- ринбург, 2015.
8.2.3.Общая и медицинская генетика: Учебное пособие для студентов высших медицинских учебных заведений. /В.П. Щипков, Г.Н. Кривошеина. – М.: Издательский центр «Академия», 2003г.
8.2.4.Шевченко В.А. и др. Генетика человека. Учебник для студентов высших учебных заведений. М.: Гуманитарное издание центр ВЛАДОС, 2002г.
Занятие №17
1.Тема занятия: Методы изучения ДНК. Секвенирование.
2.Цель занятия: Познакомиться с современными методами ДНК-диагностики наслед-
ственной патологии, методами амплификации и рестрикции ДНК.
3.Задачи занятия:
3.1.Изучить основные этапы методики выделения ДНК.
3.2.Знать механизм полимеразной цепной реакции.
3.3.Знать этапы полимеразной цепной реакции.
3.4.Знать области применения полимеразной цепной реакции.
3.5.Изучить методы детекции продуктов полимеразной цепной реакции.
3.6.Изучить лигазную цепную реакцию.
3.7.Знать рестрикционные методы анализа генома.
3.8.Изучить анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов.
78
3.9.Изучить метод секвенирования.
3.10.Знать виды секвенирования.
4.Продолжительность занятия 3 часа
5.Контрольные вопросы по теме:
Для успешной работы на практическом занятии необходимо знать теоретический ма-
териал:
Тема: Методы изучения ДНК. Секвенирование.
5.1.Что может служить объектом для выделения ДНК?
5.2.Что представляет собой амплификация?
5.3.Что такое полимеразная цепная реакция?
5.4.Опишите механизм полимеразной цепной реакции.
5.5.Назовите основные этапы ПЦР.
5.6.Какие виды детекции продуктов ПЦР вы знаете?
5.7.Что такое полиморфизм длин рестрикционных фрагментов?
5.8.Перечислите основные этапы ПДРФ-анализа.
5.9.Дайте определение понятию секвенирование.
5.10. В чем заключается суть дидезокси-метода секвенирования?
5.11.Опишите методику автоматического секвенирования.
6.Задания и методические указания к их выполнению.
На занятии студенту необходимо:
6.1. Выполнить самостоятельную работу:
Составить конспект по теме занятия:
ДНК-диагностика наследственных заболеваний
Конец XX века ознаменовался созданием революционных технологий в различных сферах человеческой деятельности и, в частности, в биотехнологии и генной инж е- нерии. Наряду с возникновением принципиально новых направлений в медицине, таких как генная терапия и генная фармакология, успешно применяются в практике совреме н- ных клинико-диагностических лабораторий методы ДНК-диагностики, среди которых, безусловно, первое место занимают полимеразная цепная ре акция и гибридизация ДНК. После первых лет внедрения ДНК-диагностики в практическое здравоохранение стало ясно, что в ближайшее время произойдет внедрение новых систем - биологичских чипов. Однако следует признать, что уровень информированности медицинских работников сильно отстает от современного уровня развития молекулярной генетики и, в конечном итоге, приводит к формированию причин, по которым внедрение новейших технологий, и создаваемых на их основе диагностических систем, становится весьма затруднительным.
В связи с этим авторы методического пособия постарались описать, не претендуя на подробное описание всех деталей, основные методические приемы, активно разв и-
79
вающиеся в настоящее время и уже нашедшие свое применение в коммерчески реализуемых наборах реактивов, тест-системах и приборах.
Выделение нуклеиновых кислот
Выделение нуклеиновых кислот (ДНК, РНК) из биологических материалов чел о- века является неотъемлемой и важной частью любого из молекулярно -генетических методов диагностики.
Этот этап в зависимости от целей исследования представлен двумя вариантами:
1.Выделение геномной ДНК из ядросодержащих клеток.
2.Выделение ДНК из биологических жидкостей (плазма, сыворотка, спинн о- мозговая жидкость, слизь).
Впервом случае источником ДНК могут быть любые ядросодержащие клетки - лейкоциты периферической крови, клетки хориона и амниотической жидкости, клеточные культуры. Для проведения анализа обычно требуется от нескольких нанограммов (10-9 кг), до нескольких микрограммов (10-6 кг) ДНК в зависимости от цели исследования. При этом клеточного материала требуется сравнительно немного, например 1 мл крови, 20-40 мг хориона, 5-10 мг культуры клеток. Важным является то, что геномная ДНК одинаково пригодна для различных методов исследования и может долго сохр а- няться в замороженном виде.
Выделение ДНК из биологических жидкостей необходимо лишь в некоторых сл у- чаях, например для определения циркулирующих в крови вирусов или ДНК разруши в- шихся клеток.
Наиболее распространенным методом выделения ДНК является метод фенольной депротеинизации, который одинаково пригоден для выделения ДНК из ядросодержащих клеток и из биологических жидкостей.
Методы амплификации ДНК и электрофоретическая детекция Полимеразная цепная реакция (ПЦР) - реакция матричного синтеза, в ходе ко-
торой происходит многократное копирование (амплификация) тестируемого участка ДНК в процессе повторяющихся температурных циклов.
Разработке методики ПЦР сопутствовало развитие некоторых технологий. В частности, появление приборов, позволяющих автоматически синтезировать короткие одноцепочечные фрагменты ДНК - олигонуклеотиды, а также открытие термофильных микроорганизмов, живущих в горячих источниках (гейзерах). Ферментативная система экстремальных термофилов способна функционировать при высоких температурах. ДНК-полимераза этих организмов выдерживает многократное повышение температуры до 95˚С без потери биологической активности, что является необходимым условием для проведения ПЦР.
Итогом этого стала разработка сотрудником фирмы "Cetus" Кэри Мюллисом в 1983 г. полимеразной цепной реакции, за которую он в 1993 г. был удостоен Нобелевской премии.
80